人口与区域发展研究所主要设立了三个研究室，即人口发展与人口政策研究室、空间信息技术研究室、城市化与区域发展研究室；研究方向主要包括：区域人口分布、人口结构与人口流动研究、人口政策与区域发展研究、区域城镇化、区域经济发展、区域可持续发展研究、“3S”技术的理论与应用研究、国土资源管理理论和技术方法研究、生态环境保护与监测、城市公共政策、公共资源与社会保障研究、城市管理运行机制及城乡统筹发展研究。